Как правило доменов можно размещать бесконечное количство.
Рассмотри на примере. Имеется папка для сайта site.ru/public_html/ . Добавлям два домена web1.ru web2.ru, присваиваем его к нужному разделу с сайтом. Добавляем две папки для новыйх сайтов, должно получится так site.ru/public_html/web_1.ru/ и site.ru/public_html/web_2.ru/
Добавляем site.ru/public_html/.htaccess с таким содержимым:
RewriteEngine On
RewriteRule ^web_2.ru/ - [L]
RewriteCond %{HTTP_HOST} (www.)?web_2.ru [NC]
RewriteRule (.*) web_2.ru/$1 [L]
RewriteRule ^web_1.ru/ - [L]
RewriteCond %{HTTP_HOST} (www.)?web_1.ru [NC]
RewriteRule (.*) web_1.ru/$1 [L]
Сайты размещаем в соответсвующих директориях. Теперь у вас ограничение только в размере жесткого диска!